R Markdownのアウトプットをどうやってブログに書くか
R Markdownが便利なんですけどね
RStudioを使っているのですが、ドキュメントにまとめるのにR Markdownで記述していると結構便利で、
何が便利かというと、Markdownの中でRが実行できて、Rの実行結果のアウトプットを簡単に埋め込めるのです。
そして、それをPDFやHTMLとして保存できます。便利です。
何がしたいのかというと
RStudioで保存した、R Markdownの実行結果のhtmlをアウトプットとして、ブログに簡単に掲載したいのです。
要は、Hatena Blogでhtmlをホストできればいいのですが。。。
作成したhtmlをアップロードするだけとか。
一旦、GitHubにホストしてみたんですけどね。。。面倒。
こんな感じ
作成されたhtmlをいい感じにジェネレートしてくれるものがあれば、GitHubでいいのかな。
当分は、GitHubへのリンクになりそうｗ
「みんなのR」でRの基礎からお勉強1
「みんなのR」を購入しました
- まだ始めたばかりですが、基本的なツールのインストール、操作、設定から丁寧に書かれていてとてもわかり易いです。
- また統計に関する項目としても、基本的な項目があるように思います。まずはこの1冊をきっちりやれば次に繋がりそうな気がします。
- アウトプットについては、RStudioで実行したログが中心になります。
- 主に私の備忘録的なもののアウトプットです。
- 作者: Jared P. Lander,Tokyo.R（協力）,高柳慎一,牧山幸史,簑田高志
- 出版社/メーカー: マイナビ
- 発売日: 2015/06/30
- メディア: 単行本（ソフトカバー）
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基本的な数学
1 + 1 1 + 2 + 3 3 * 7 * 2 4/2 4/3 4 * 6 + 5 ( 4 * 6) + 5 4 * (6 + 5)
変数の代入
一般的な代入方法
x <- 2 x
= も使用できる
y = 5 y
向きを反対にしてもできる
3 -> z z
代入演算子を連続して用いることもできる
a <- b <- 6
a = b = 7
## assign関数を使った代入
assign("j", 4)
j
関数の削除
remove(j) rm(j) j
データ型
主に使われる4つのデータ型(numeric / character / Date, POSIXct / logical)
変数が保持するデータの型を調べたいときは、class関数を使う
class(a)
numeric
numericは、整数と少数、正数と負数、ゼロを取り扱う
numericかどうか確認する
is.numeric(a)
使用頻度低いintegerは、正数のみを取り扱う
変数に整数を代入するには、数字の後ろにLをつける必要がある
i <- 5 j <- 5L
> class(i) [1] "numeric" > class(j) [1] "integer" >
integerかどうか確認する
> is.integer(i) [1] FALSE > is.integer(j) [1] TRUE >
jがintegerのとき、iはnumericのテストも通ることに注意する
> is.integer(i) [1] FALSE > is.integer(j) [1] TRUE >
文字データ
Rは文字データを扱う基本的な型として、characterとfactorがある
characterは大文字と小文字を区別します
x <- "data" x
> is.character(x) [1] TRUE > is.numeric(x) [1] FALSE > is.factor(x) [1] FALSE >
y <- factor("data")
y
> is.character(y) [1] FALSE > is.numeric(y) [1] FALSE > is.factor(y) [1] TRUE >
characterまたはnumericの文字の長さを調べるには、nchar関数を使う
> class(x) [1] "character" > class(y) [1] "factor" > nchar(x) [1] 4 > nchar(y) nchar(y) でエラー: 'nchar()' は文字ベクトルを要求します
日付
Rでは日付と時間を扱う型が複数あり、最も役に立つ型はDateとPOSIXct
as.numericおよびas.Date関数は、単にオブジェクトの形式を変えるだけでなく。根本的な型の変更を行います
> date1 <- as.Date("2015-07-19")
> date1
[1] "2015-07-19"
> class(date1)
[1] "Date"
> as.numeric(date1)
[1] 16635
> date2 <- as.POSIXct("2015-07-19")
> date2
[1] "2015-07-19 JST"
> class(date2)
[1] "POSIXct" "POSIXt"
> as.numeric(date2)
[1] 1437231600
class(date1) class(as.numeric(date1))
論理値
logicalはTRUEもしくはFALSEのどちらかの値をのみをとるデータを表します
数値的には、TRUEは1で、FALSEは0と同じ
> TRUE * 5 [1] 5 > FALSE * 5 [1] 0
他の型と同様に、is.logical関数を使ってlogicalかどうかをテスト
k <- TRUE class(k) is.logical(k)
Rでは、TRUE/FALSEを短縮してT/Fと記述できるが、あまり使わないらしい
> l <- T > m <- F > class(l) [1] "logical" > class(m) [1] "logical" > l * 5 [1] 5 > m * 5 [1] 0
2つの数値または文字を比較すると、結果としてlogicalが得られる
> 2 == 3 [1] FALSE
> 2 != 3 [1] TRUE
> 2 < 3 [1] TRUE
> 2 <= 3 [1] TRUE
> 2 > 3 [1] FALSE
> 2 >= 3 [1] FALSE
> "data" == "stats" [1] FALSE
> "data" < "stats" [1] TRUE
boot2dockerでSSLエラー
boot2dockerでSSLエラー
コマンド何実行して以下のようなエラーがでる
An error occurred trying to connect: Get https://192.168.59.103:2376/v1.19/version: x509: certificate is valid for 127.0.0.1, 10.0.2.15, not 192.168.59.103
ぐぐる
- TLS無効にすればいいよねというのは、すぐに分かっても、どうやればいいのかがわからない
- ここを参考にprofileを編集するとうまくいった
- 技術的には、こちらの方が納得感がある
- TLSを無効にする設定を入れて動作確認
[11:45] % boot2docker stop [~]
[11:45] % boot2docker start [~]
Waiting for VM and Docker daemon to start...
............o
Started.
To connect the Docker client to the Docker daemon, please set:
export DOCKER_HOST=tcp://192.168.59.103:2375
unset DOCKER_CERT_PATH
unset DOCKER_TLS_VERIFY
[11:46] % docker version [~]
Client version: 1.7.0
Client API version: 1.19
Go version (client): go1.4.2
Git commit (client): 0baf609
OS/Arch (client): darwin/amd64
Cannot connect to the Docker daemon. Is 'docker -d' running on this host?
[11:46] % docker images [~]
Cannot connect to the Docker daemon. Is 'docker -d' running on this host?
[11:46] % unset DOCKER_CERT_PATH [~]
[11:47] % unset DOCKER_TLS_VERIFY [~]
[11:47] % export DOCKER_HOST=tcp://192.168.59.103:2375 [~]
[11:47] % docker images [~]
REPOSITORY TAG IMAGE ID CREATED VIRTUAL SIZE
centos latest 7322fbe74aa5 3 weeks ago 172.2 MB
centos centos5 9069226e092e 11 weeks ago 284.1 MB
hello-world latest 91c95931e552 12 weeks ago 910 B
gpmidi/centos-5.3 latest c538b96552fd 12 months ago 524.3 MB
